1924年，东南大学决定停办工科，工科并入河海工程专门学校，更名河海工科大学，仍隶属全国水利局，第一任校长：茅以升。

1927年，南京国民政府实行大学区制，全国设立四所中山大学。苏州工业专门学校、南京工业专门学校、国立东南大学、河海工科大学、上海商科大学、江苏法政大学、江苏医科大学、南京农业学校、上海商业专门学校合并组建国立第四中山大学 。

1928年2月，第四中山大学改名为江苏大学；4月定名国立中央大学。下设文、理、法、教育、农、工、商、医8个学院，是当时国内院系最全，规模最大的大学。