国家体育总局运动医学研究所（简称运医所）是国家体育总局直属事业单位，单位规格为正司级。其下设6个中层机构：办公室、科研处、国家队医务管理处、运动员医疗中心（体育医院）、运动医学研究中心、运动员营养研究中心。

运医所是总局直属唯一从事运动医学临床、研究与下队服务的研究单位，现有卫生系列正高职9人、副高职20人；研究系列正高职3人、副高职3人；其他系列副高2人；中级及以下职数63人。经过多年的发展，运医所已有相当一部分学科内运动医学界处于领先地位。在最近几届奥运会的备战工作中，运医所作为牵头单位，组织完成了众多总局、科技部以及国家自然基金委员会的科研课题，具备强的科研能力，也培养了一大批科研临床工作学科带头人。目前有两个总局重点实验室挂靠在运医所：医务监督与运动创伤实验室、运动营养实验室。此外，运医所一直是中华医学会运动医学分会、中国体育科学学会运动医学的挂靠单位，分会的工作由所主要领导负责管理。