固有耐药性（intrinsic resistance）是指细菌对某种抗菌药物的天然耐药性.固有耐药性是始终如一的,由细菌的种属特性所决定的.如肠道阴性杆菌对青霉素；铜绿假单胞菌对氨苄西林以及链球菌属对庆大霉素都属于固有耐药性。

如氨基糖苷类抗生素必须借助氧依赖的转运机制进入微生物体内，而厌氧菌缺乏此机制而对氨基糖苷类抗生素产生固有耐药性。