个体古生态学（paleoautecology）是古生态学的一个分支学科。研究地史时期单个生物、居群或一个特定分类单元与环境之间关系的科学。个体古生态学一名并不恰当，易于误解，但习用已久，故仍沿用。个体古生态学是古生态学研究的基础，它和综合古生态学是古生态学研究的两个方面，不能截然分开。