高士其故居位于福州市鳌峰坊东口南侧，背靠于山，为明代迟清亭旧址。始建于明代，坐南向北，四面风火墙，前后五进，面积2500多平方米。

1号花厅原有四进，除第一进为三开间住房外，二、三、四进为假山、鱼池、花园阁楼，迟清亭即建在此。清道光年间后，多被改为住房。民国初期，高士其父亲高赞鼎在花厅二进鱼池东侧建一幢双层小楼，它是高士其青少年时期的住房。花厅现仅存两进，占地面积仅四百平方米。

3号主座前、后共五进，入石框大门为首进，穿斗式木构架，硬山屋顶。三面环廊，厅堂三开间，中间为厅，两旁有前、后厢房，左厢房为其父高赞鼎、母何吟阁住房。二、三进同样是三开间，有插屏门隔成前后厅，厅两侧为前后厢房，前后厅都有天井，前天井两侧有披榭。四进也是三开间，双层楼房，楼上供佛，五进为倒朝三间排，已圮。每进都有小门通向东侧花厅，现仅存两进共八百平方米。

1991年，市人民政府公布高士其故居为名人故居。1992年，列为鼓楼区文物保护单位。

2003年初，市文物局对高士其故居进行分期拆迁、修复。1号花厅进行落架大修，主要修复了天井、回廊、前后花厅、书房、鱼池、双层小楼。其中双层小楼保留了民国时期的西洋建筑风格，鱼池水为活水，鱼池周边是民国时期风格的铁花护栏。

2005年，在高士其诞辰一百周年之际，全面修复后的高士其故居辟有《高士其故居陈列展览》，展出面积近一千平方米，展出各类实物一百余件、图表照片一百多幅。同时，复原了高士其的两间办公室和他母亲的一间卧室。高士其故居展览分两大部分，第一部分为陈列展览，内容有人生历程、献身科普、关爱孩子、温馨友谊、故土亲情五部分；第二部分复原部分，分高士其母亲的卧室、高士其北京书房及会客厅复原摆设三个展室。高士其基金会捐赠了大量高士其先生的遗物，这批遗物数量多、种类全，为丰富《高士其故居陈列展览》内涵提供了必要的条件。

高士其故居的修复和陈列展览将为高士其所倡导的科普知识继续传播提供坚实的平台，也将成为福州市又一个宣传爱国主义的教育基地。