敦煌市中医医院始建于1983年9月，是省级首批“二级甲等中医医院”和“爱婴医院”。总院地处敦煌市南大街，分院设在小北街，占地面积5131.7平方米，总建筑面积7392平方米，固定资产3000余万元，医院开放病床150张。全院现有正式职工106人，中医药护人员中卫技人员总数的70%以上，设有中西医结合内、外、妇、儿、急诊、眼、耳鼻咽喉、口腔、肛肠、泌尿、骨伤等23个临床科室和放射、检验等6个医技科室。中西医结合眼科、肛肠科、泌尿科、创伤科、针灸推拿科、糖尿病、风湿病、哮喘病等专科专病已形成辐射周边县区的特色医疗。有“自制风湿Ⅱ号电离子导入治疗风湿类疾病”、“滋肾蓉精降糖胶囊治疗Ⅱ型糖尿病”、“白内障囊外摘除加人工晶体植入术的临床应用”等40余项科研成果分别荣获地、市级科技进步奖，发表学术论文200余篇。

医院始终坚持“以人为本、科技兴院、专科带院、服务活院、服务社会、造福人类”的办院思路，把“发挥中医优势，突出中医特色，弘扬中医传统文化、狠抓专科专病建设”作为医院科学发展的突破口，按照“只有大投入，才能大发展”的先进理念，先后购进进口螺旋CT、进口彩超、800MA数字胃肠机、血液透析仪、电视胃镜、500mA电视X光机、CR、经颅多普勒、全自动生化分析仪、眼底血管造影仪、微量元素测定仪、熏蒸机等先进医疗设备180余台件，大大提升了医院中西医结合诊疗疾病的手段，满足了不同层次人民群众的医疗保健需求。

在建院近30年的风雨历程中，医院狠抓人才队伍建设，坚持以制度留人心，用待遇安人心，以舞台鼓人心，用感情暖人心，不断引进人才，培养人才，留住人才，使科室功能日益健全完善，特色科室迅速发展。

文化凝聚力量，和谐促进发展，中医院根据中医发展趋势和人民群众的健康需求提出了“一年发展靠机遇，十年发展靠机制，百年发展靠文化”的发展思路。去年以来，中医院通过征集首次确定了医院院徽，院训，院歌；常年在电视台开展以“弘扬中医，传播健康”为主题的中医健康知识讲座；利用建院院庆之际，举办了以“医患携手，共赢健康”为主题的第一届敦煌中医文化节；通过“内引外联”，引进召开 “2010国际针法灸法技术演示暨学术会”、“全国中医院院长会议”等5次国家级会议、今年9月承办了以“传承中医国粹，传播优秀文化，共享健康和谐”为主题的“敦煌中医文化宣传周”活动等。一系列活动的开展增强了广大群众对中医药的亲和力和吸引力，赢得了广大人民群众的信赖，有力地推进了敦煌医学和敦煌中医文化建设工作的大发展。

医院先后荣获甘肃省诚信建设单位示范点、地级文明单位、全市窗口行业创建文明系统示范点、诚信单位、“三·五”普法先进单位、思想政治工作先进集体、民族团结先进集体等荣誉称号，同时，长期承担甘肃中医学院、省中医学校、酒泉卫生学校等院校的教学医院工作，并被确定为本市人寿保险公司定点医院和远涉青海海西州、阿克塞等周边地区的医保定点医院。