东南大学临床医学院始建于1935年，其前身为中央大学医学院临床医学系，曾培养出多名包括中国工程院院士在内的国内外著名医学专家。

目前，临床医学院与附属中大医院为一体化运作，共同完成教学、医疗、科研等任务。学院现设有临床医学系（含七年制本硕连读临床医学专业）、医学影像系、医学检验系、高级护理系等四个本科专业。在临床医学本科教育、硕士研究生培养方面，已积累了丰富的教学经验，并建立了较完备的教学管理体系，已为全国各地三级医院培养了大量临床医学专家，并有众多学子分赴世界各地继续深造。

东南大学临床医学院是生命科学领域一所集教学、医疗、科研为一体的综合性学院。学院设有临床医学系、医学影像学系、医学检验系、护理系4个本科专业，一所直属附属医院——中大医院，九所非直属附属医院。

在临床医学本科教育、硕士研究生培养方面，学院积累了丰富的教学经验，建立了完备的教学管理体系。学院招收五年制临床各专业本科生、七年制本硕连读临床医学专业学生，所有硕士点均可招收临床医学专业学位硕士研究生，医学影像核医学专业可招收博士研究生。

临床医学院二级学科硕士点有内科学、外科学、妇产科学、儿科学、眼科学、耳鼻咽喉科学、急诊医学、神经病学、中医学、影像医学与核医学、临床检验诊断学11个学科。内科学覆盖有心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病8个三级学科，外科学覆盖有普外科、骨外科、泌尿外科、神经外科、整形外科、胸心外科、烧伤外科7个三级学科。临床医学院博士点有医学影像核医学专业。医学影像与介入放射学科、整形修复学科是江苏省“135”医学重点学科，急症医学学科是省重点学科建设单位。

中大医院设有部级心血管疾病防治技术中心、中华医学会实用介入技术推广培训中心、微创治疗技术中心、血液净化中心、眼科口腔科中心、全科医学中心及一个颇具规模的现代化临床实验中心，心血管实验室为部级开放实验室。中大医院心血管内科、血液内科、消化内科、急救医学科、普外科、整形外科、神经外科、骨外科及放射诊断科为省级临床医学重点专科。

东南大学介入放射学研究所、急诊与危重病医学研究所、心血管病研究所、微创外科研究所、功能神经外科研究所、修复重建外科研究所、耳聋康复研究所、骨髓增生异常综合症研究所等一批医学学术研究机构设在该院。

学院具有高级职称人员150余人，获得博士和硕士学位者136人，博士生导师3人，硕士生导师71人，享受国务院特殊津贴29人，留学归国人员26人，有突出贡献的中青年专家4人，江苏省医学重点人才10人，江苏省跨世纪学术技术带头人培养对象8人，教育部骨干教师计划资助对象3人，铁道部科技拔尖人才11人，全院有36人分别担任全国及省、部级医学杂志主编、副主编、编委等职务，102人担任各类医学专业委员会主委、副主委、委员职务。1990年以来承担国家自然科学基金项目10余项，通过鉴定的科技成果80多项，获得省部级及国家级科技进步奖近70项。近十年来，在国际性刊物上发表论文40多篇，其中SCI收录论文30篇。在全国核心期刊上发表论文1000多篇，省部级刊物上发表论文2600余篇。近年来，学院不断加强国际合作与交流，先后与美、德、英、日、俄等国医学院校建立了友好关系，经常开展国际学术交流及科研合作活动。