1950年5月17日，舟山解放，9月，成立定海县人民法院。1953年2月建立舟山专区，8月，浙江省人民法院舟山分院成立，辖定海、普陀、岱山、嵊泗四个县法院。1955年1月，舟山分院改称浙江省舟山地区中级人民法院。1959年8月，改称舟山县人民法院。1962年7月，恢复舟山地区中级人民法院。1967年12月，成立地区公检法机关军事管制委员会。1973年3月，恢复舟山地区中级人民法院，1987年1月舟山撤地建市后，于同年4月改称舟山市中级人民法院，辖定海、普陀两区和岱山、嵊泗两县人民法院。

法院成立初期，办公地点位于定海中大街。1953年初，搬迁至定海西大街。1973年3月，搬迁至定海解放西路。1983年7月，迁至现定海海泳路1号。1996年9月，迁至位于定海昌国路215号的法院大楼。现审判办公大楼位于临城新区千岛路221号，大楼于2004年3月5日奠基兴建，2006年 5月26日竣工使用。

舟山市中级人民法院的主要职责是：依法审判一、二审刑事、民事、行政及各类再审案件；审核裁定减刑、假释案件；依法行使司法执行权，统一管理和协调全市人民法院的执行工作；指导基层人民法院的审判工作和思想政治、教育培训等工作；协调、规划全市人民法院的“两庭”建设。

舟山市中级人民法院下辖定海、普陀两区和岱山、嵊泗两县人民法院，4个基层法院又下辖人民法庭13个。近年来，全市法院年均办理案件1万件左右。

舟山市中级人民法院内设十五个部门，截至2009年，有在编干警101人。