重庆市地震局始建于2001年，实行由中国地震局和重庆市人民政府双重领导，以中国地震局领导为主的管理体制。它既是中国地震局的派出单位，又是重庆市人民政府管理地方防震减灾工作的职能部门。

重庆市地震局由局机关职能处室、下属事业单位和地震台组成。机关职能处室设有办公室、人事教育处（离退干部管理处）、计划财务处、监测预报处（科技发展处、外事办公室）、震害防御处（法规处）、应急救援处、纪检监察审计处、机关党委(机关工会)等处室。下属事业单位设有重庆地震监测预报中心（重庆三峡水库地震监测中心）、重庆市地震应急与宣传教育中心、重庆市地震工程研究所、重庆市地震台。

管理职能主要为：根据有关法律、法规、规章的规定，监督、检查本行政区域内的防震减灾工作，负责拟定有关防震减灾的方针、政策，起草地方性法规、规章，制定规范性文件，并组织实施；组织编制本行政区域的防震减灾规划和计划；负责建立地震监测预报工作体系；会同有关部门建立震灾预防工作体系，管理地震安全性评价工作；管理本行政区域内地震灾害预测；组织开展防震减灾知识的宣传教育工作；承担市级人民政府抗震救灾指挥机构职能；会同有关部门建立地震紧急求援工作体系；指导区县防震减灾工作；承担中国地震局和重庆市人民政府交办的其他事项。