重庆市巴南区中医院是一所国家二级甲等医院、爱婴医院、ISO9001:2000国际质量认证医院；重庆市交通事故快速抢救定点医院、重庆市放心药房巴南区首家授牌医院；巴南区诚信医院、城镇职工医疗保险、工伤保险、生育保险定点医院、农村新型合作医疗定点医院、老干部医疗保健定点医院；保险公司医疗保险定点医院；重庆医科大学中医药学院、重庆市护士学校教学实习医院；全区中医医疗、教学、科研基地；区级最佳文明单位。

医院共有在职职工172人，其中卫生专业技术人员145人；医院占地面积53亩，建筑面积32000平方米。门诊部设内科、外科（普外、脑外、泌尿外科）、儿科、骨伤科、妇产科、口腔科、五官科、皮肤科等临床科室。