中央农业干部教育培训中心新疆农业大学分院成立于1980年9月，目前，与新疆农业大学成人教育学院、新疆农业大学继续教育学院、新疆农业大学高等职业教育学院合著办公。是农业部建在西北地区的农业干部教育培训基地之一，主要承担西北地区县以上主管农业工作的党政领导干部、农业行政部门领导干部和高中级农业专业技术人员的培训任务。 新疆农业大学分院经过近30年的建设和发展，已有占地面积6000多平方米、校舍建筑面积5775平方米的干部培训基地，有可供200多人同时就餐的餐厅。有微机室、多媒体教室。院内环境优美、安静，学习、生活条件优越。

新疆农业大学分院依托新疆农业大学雄厚师资力量和教学科研条件开展干部教育工作。面向农业第一线，面向基层，面向边远贫困地区，为新疆的农牧业生产和经济建设培养合格的各民族专业技术和管理人才。目前已形成了多规格、多层次、多形式的立体成人教育体系，各类成人在校生2000余人，30余年来，共同培养成人专业技术人才10000余人。自1980年以来，举办了各类农业干部培训班、农业专业技术继续教育培训班，农牧局长班，县处以上领导干部班100多期，培训学员4000余人。广大干部通过培训，提高了政治业务素质，为新疆农村经济发展和农业现代化建设做出了较大贡献。

1998年研究课题"新疆县级农业大学领导干部培训的问题及对策"，被评为总院优秀课题。论文《大力发展新疆农业成人教育》、《改革高等农业成人招生制度，推动高等农业成人教育事业发展》被收入农业部《高等农业成人教育的理论与实践》论文集。编辑出版了107万字的《新疆扶贫攻坚课程》一书及自治区农口专业人员继续教育各类教材。