寄生虫学科于1949年从生物学科分支出来，成为一个独立的教学、科研实体。1954年正式成立寄生虫学教研室。1964年经卫生部批准建立血吸虫病研究室。1985年研究室与教研室分开并更名为寄生虫学研究室，1987年重新合并，但仍保留两块“招牌”。1989年又将研究室重新更名为血吸虫病研究室。2001年与微生物学教研室合并组建病原生物学系。