中国港口协会科学技术奖是2006年11月1日经国家科技部批准登记的全国性社会力量设奖。
2008年3月27日，首届“中国港口协会科学技术奖”颁奖仪式在青岛举行，共有64个项目获奖。其中，一等奖4项，二等奖28项目，三等奖32项。
2009年度已是第三次申报，全国港口企业及与港口有关的科研机构、高等院校共申报了97个项目，申报项目经过形式审查和公示，并由专家组初评，再对初审入围一、二等奖的项目进行裁决，最终产生一等奖1项、二等奖16项、三等奖37项。
2010年度中国港口协会科技奖于日前揭晓，共评选出一等奖1项，二等奖17项，三等奖32项。