中国大学校长联谊会1997年11月成立，旨在加强交流合作，提高办学水平。已先后在上海、西安、杭州等地举行了多次年会及论坛交流活动。本次中国大学校长联谊会2009年会暨校长论坛的主题是“大学的学术权力与行政权力”，中国科大校长侯建国在论坛上作了《学术权力与行政权力的协调互动》专题报告，介绍了中国科大坚持学术优先、民主办学的经验与实践。

2010年10月10日，中国大学校长联谊会2009年会暨校长论坛在西安交通大学举行。在本届年会上，中国大学校长联谊会理事会决定接纳中国科技大学和哈尔滨工业大学为联谊会成员。至此，连同原有成员单位北京大学、清华大学、浙江大学、复旦大学、南京大学、上海交通大学、西安交通大学以及香港大学、香港中文大学、香港科技大学，在我国享有盛誉的中国大学校长联谊会成员单位已增至12所。