远缘杂交通常是指植物分类学上不同种、属以上类型间的杂交。通过远缘杂交一方面可以获得物种间的亲缘关系；另一方面，还可以创造出新的植物类型，如芜菁甘蓝（AACC，2n = 4x = 38）起源于芸薹属中2n = 2x = 20（AA）的芸薹与2n = 2x =18（CC）的甘蓝的种间杂交；芥菜（AABB，2n = 4x = 36）起源于芸薹属中2n = 2x = 20（AA）的芸薹与2n = 2x = 16（BB）的黑芥的种间杂交；欧洲李（AABBCC，2n = 6x = 48）来自樱桃李（AA，2n = 2x = 16）和黑刺李（BBCC，2n = 4x = 32）间的杂交。除此之外，远缘杂交还可以大大提高植物的抗病（逆）性、改良品质、创造雄性不育以及利用杂种优势等特点，可以解决近缘杂交所不易解决的问题，因此，通过远缘杂交分析，可以获得园艺植物资源上述目标农艺性状的相关信息，为进一步开发和利用现有的资源提供研究基础。