代谢物（metabolite）亦称中间代谢物，是指指通过代谢过程产生或消耗的物质，生物大分子不包括在内。生物大分子的前体及降解产物是真正的代谢物。

代谢过程中在酶作用下生成或转变的小分子化合物也称作代谢物。