浙江工商大学日本文化研究所最早创建于1989年的杭州大学，经历“四校合并”后的浙江大学，2004年8月搬迁到浙江工商大学。2006年本所被日本国际交流基金会指定为“海外日本研究重点支援机构”，作为中国“日本历史文化”研究基地，开展一系列研究计划和国际交流活动。

研究所奉行自创办以来“立足本地，放眼世界”的宗旨，广集国内外优秀人才，倡导跨学科、学术化的国际交流，力图构建学术研究、教育培训、图书资料、网络资源的中心。现有研究人员12名，其中教授2名，副教授6名、讲师1名、助教3名，配备专职行政秘书1名、研究助理2名。拥有博士生导师2名、硕士生导师3名，具有硕士学位授予权，在“日本文化”和“日本历史”两个研究方向招收研究生；此外，还与浙江大学、广东外语外贸大学合作，招手日本研究的博士生。

2007年，“日本文化研究楼”在浙江工商大学下沙新校区于2008年7月竣工。面积达2000余平方米的大楼建成后，将为国际学术交流提供新的平台。