张祖恩（1951年—），台湾彰化县人。1973年获台湾国立成功大学土木系学士，1975年获国立成功大学土木系硕士，1982年获日本东北大学博士、成大环工系教授。曾任成功大学环工系主任，工学院副院长。

2001年4月由前环保署署长郝龙斌延揽，借调出任环保署副署长，于2003年10月底真除署长一职。2003年10月到2005年4月第七任行政院环境保护署署长。2005年离任后，返成大任环工系教授。

经历:

行政院环境保护署综合计划处副处长

(1989年-1990年)

国立成功大学工学院副院长

( -2001年4月20日)

国立成功大学环境工程系系主任

国立成功大学研究发展基金会执行长

中华民国环境工程学会（第五届）委员

行政院环境保护署副署长

(2001年4月20日-)