洋山保税港区经国务院批准设立，2005年12月10日在洋山深水港开港的同时正式启用，是上海市和浙江省跨区域合作建设，实行海关封闭监管的特殊功能区域，也是我国第一个保税港区。

洋山深水港的建设是一项国家战略。洋山保税港区的开发是贯彻落实科学发展观，实施国家战略，加快建设上海国际航运中心和现代化国际大都市的重大举措。

2009年，国务院赋予洋山保税港区探索建设国际航运发展综合试验区的重要使命。保税港区正在成为航运物流服务进一步与国际惯例接轨、航运金融服务进一步对外开放、区域运作监管进一步创新的先行先试示范区。

洋山保税港区由小洋山港口区域、陆域部分和连接小洋山岛与陆地的东海大桥组成，已封关运作面积8.14平方公里。