杏林港区是为杏林工业区原材料和产品运输服务的中、小泊位港区。主要泊位布置于马銮海堤东侧，陆域纵深较小，其中有1978年建成的新华玻璃厂(后更名为明达玻璃有限公司)专用码头1个，为3000吨级泊位，泊位长60米，年设计吞吐能力12万吨。1987年2月建成涤纶厂化工专用码头1座，为3000吨级泊位，泊位长60米，码头工程为重力式基础，钢筋混凝土墩桩式，突堤T型结构，年设计吞吐能力12万吨，总投资325万元。