新疆青少年发展基金会1992年由自治区团委、自治区青联、自治区学联、自治区少工委联合发起成立，以服务青少年发展为目标，涵盖了青少年健康成长的全过程。创建之初为自收自支事业单位，后经几任团委领导努力于2002年正式确立为全额拨款事业单位。现单位性质一方面是事业单位，另一方面又是依照国务院《基金会管理条例》在自治区民政厅社团处登记的地方性公募基金会法人。目前，基金会依照新人社发【2009】140号文件定员9名，其中管理岗位5名，专业技术岗位4名；管理岗位中，五级岗位1名（相当于正处级），六级岗位2名（相当于副处级）。

新疆青基会成立后，参照中国青基会和各兄弟省市青基会模式分别设立了希望工程助学基金、青少年活动阵地建设基金、青年人才和青年工作者奖励基金等多个基金项目，但由于多种主客观原因仅运作了希望工程助学基金。希望工程是改革开放以来共青团创立的最成功、最具影响力的全国性公益品牌之一，她为无数贫困青少年送去了关爱和支持，让他们实现了上学的梦想。新疆青基会就是依托希望工程这一著名品牌不断发展壮大，成立19年来，累计募集各类善款、物资约1.5亿元，在全疆援建希望小学460所，希望双语幼儿园12所，希望医院1所，资助贫困学生70000余名，培训希望小学教师250名，捐赠希望数字影院31套、希望三辰影库35套、希望网校38套、希望书库372套，捐建希望工程快乐体育园地135套，为我区贫困地区青少年的健康成长和教育事业的发展做出了积极的贡献。

新疆青基会资助项目包括：援建希望双语幼儿园、希望工程圆梦行动（结对资助贫困学生）、援建希望小学、援建乡村希望卫生室、援建希望电脑室、捐置农牧区寄宿学校希望厨房、援建希望（双语）语音室、捐置希望数字影院、捐置希望书库、捐置希望多媒体教室、捐置希望音乐室、捐资设立专项爱心救助基金、捐置希望美术室、一般性捐款、捐置希望工程快乐体育园地等。