厦门大学眼科研究所成立于2007年，是一个集眼科临床与基础研究、人才培养、眼科新技术与新产品开发于一体的专业研究机构，是福建省眼科与视觉科学重点实验室依托单位。研究所秉承厦门大学“自强不息，止于至善”的校训，发扬“严谨，求实，自由，创新”的科学精神，在著名眼表与角膜病专家刘祖国教授的带领下，在较短时间内组建了一支强有力的富有创新精神的研究团队，建成了一个设备先进、技术成熟、管理完善的研究开发平台，并在短期内取得了一系列研究成果。　厦门大学眼科研究所基础研究团队现有40余人，包括长江学者特聘教授1人，厦门大学外籍讲座教授2人，客座教授2人，厦门大学专任教授2人，副教授7人，讲师、实验技术专家、博士后研究人员、访问学者、研究生等30余人。临床研究团队70余人，其中主任、副主任医师28人。研究所人才梯队完整，结构合理，大部分副教授以上研究人员有多年国外学习或工作经历，是一个朝气蓬勃，充满激情，勇于创新的研究团队。

厦门大学眼科研究所位于风景优美的厦门大学主校区，已经建成了高标准的细胞培养室，组织化学实验室，分子生物学实验室，动物实验室等一系列实验室单元，实验设备齐全，实验平台技术力量雄厚。临床研究基地厦门大学附属厦门眼科中心建筑面积近2万平方米，拥有大量现代化眼科临床设备，年门诊量近25万人次，年手术量近3万例，是目前国内专业最齐全、技术水平最高、仪器设备最先进、医疗管理最科学的眼科中心之一。

厦门大学眼科研究所目前的主要研究方向为泪液与眼表面疾病的发病机理与治疗，角膜组织工程，眼部新生血管性疾病的发生机理与治疗，角膜缘干细胞移植的基础与临床，角膜免疫，近视眼的病理机制与治疗，以及眼部肿瘤等方面的研究。各研究方向在深入探讨眼部生理、病理的同时，注重基础研究与临床应用的紧密结合，力图通过基础研究阐明疾病本质，探寻新的临床治疗方法。

厦门大学眼科研究所的科研项目获得了从国家到地方的各级资助，包括国家重点基础研究发展计划（973计划）项目，国家高科技计划（863计划）重点项目，国家自然科学基金项目，“十一五”科技支撑计划项目，卫生部临床重点项目，福建省自然科学基金项目，厦门市科技计划项目，厦门大学985工程科研平台建设项目等，近3年共获得20余项科研资助，科研经费共计2000余万元。

厦门大学眼科研究所全职研究人员近3年在角膜组织工程、角膜缘干细胞、眼表鳞状上皮化生、干眼症等方向的研究获得较多进展，在国内外杂志发表论文40余篇，其中SCI收录论文20余篇，包括Stem cells, J Pathol, IOVS, J Cell Physiol等著名杂志。参与了5部专著的撰写，研究成果申请了6项国家专利，获得厦门市科技进步一等奖1项。研究人员参加国际国内学术会议100余人次，受邀大会演讲30余人次。