与原核细胞不同，真核细胞分化成各种各样的细胞器，例如细胞核、线粒体、叶绿体、核糖体、高尔基体、内质网、液泡等。一个细胞被分为很多个这样的细胞器，这种现象称为细胞的区域化（compartmentation）。