唐显庆三年（658年），以原安西都护府故地西州置西州都护府，拜左骁卫大将军兼安西都护麴智湛为都督，令统伊、西、庭三州之地。龙朔二年（663年）十二月，改西州都督府为金山都护府。永昌元年（689年），唐军于寅识迦河（今阿克苏河）大败迢后，安西副都护唐休璟收余众，保西州，复置西州都督府，唐休璟兼西州都督。长安二年（702年）十二月六日（703年1月7日），罢废西州都督府。