西南大学教育科学研究所前身为西南师范大学教育科学研究所，1984年经教育部批准成立，主要从事教育科学研究和高层次教育科研人才的培养。经过20多年的发展，已形成学科优势明显、整体实力强，西南大学乃至国内重要的学术科研机构。现有教授8名，副教授8名，兼职教授10余名，讲师5名。在职科研人员中有博士学位者14名。有5名专家先后获准享受国务院政府特殊津贴。

教育科学研究所课程与教学论、发展与教育心理学和教育史与教育原理等三个专业的部分研究方向处于国内先进水平，均招收培养硕士、博士研究生。其中，课程与教学论、发展与教育心理学专业分别于1984年、1995年获得博士学位授予权，2000年被列为重庆市首批重点学科。教育史专业于2003年获得博士学位授予权。20多年来共招收博士生16届71人，硕士生22届299人，同时接收在职教育硕士、高校教师专业硕士、国内访问学者，接受在职人员以同等学历申请硕士学位、举办研究生课程进修班，为我国大中小学培养高层次应用型教育科研人才上千人。

西南大学教育科学研究所20多年的发展历史上，几代学人薪火相传，承前启后，使当初几个人的小型研究所得以发展壮大，形成了今天学科优势明显，专业特色突出，学术梯队合理，整体实力较强，在国内有重要影响的教育科学研究机构。建所以来，该所科研人员先后主持、主研国家级、省部级教育科研课题120余项；发表学术论文600篇，出版专著、教材等327部。其中，科研成果获国家级、省部级政府奖61项82人次。先后与美国、日本、英国、加拿大、瑞典、法国、德国、香港、台湾等国家和地区的高校和研究机构开展学术访问和交流。