民国三十一年(1942)四月一日，国民政府军政部在西昌城西莲花寺建立西昌种马所。民国三十三年(1944)，开始进行改良配种工作，在西昌县河西和冕宁县泸沽成立第1、第2分所。民国三十四年(1945)，西昌种马所更名为联勤总部西昌种马所 。1950年春撤销。