西藏自治区藏药研究院是在西藏自治区藏医院研究所(创建于1973年)的基础上政府出资300多万元进行改扩建,并在2006提升为“西藏自治区藏医药研究院”，同时西藏自治区政府拨款500万元为研究院购置了研究设备,现有建筑面积达2794平方米,专职科研人员27名,兼职65名。研究院下设科研部、藏药植化研究所、藏药药理毒理研究所、图书情报研究所、藏药生药研究所、藏医药文献研究所和天文历算研究所7个机构。是一所藏医、藏药以及藏医药文献研究和天文历算研究为主的综合性研究单位。