以中国工程热物理学科创始人吴仲华命名的“吴仲华奖励基金”设立于2007年，由中科院工程热物理研究所与中国工程热物理学会共同发起。基金设立“吴仲华优秀青年学者奖”和“吴仲华优秀学生奖”两个奖项，面向全国奖励在工程热物理学科科研成绩突出、具有创新思维的优秀青年科技人才和研究生。吴仲华是我国工程热物理学科的创始人，上世纪50年代绕道大半个地球回到祖国，先后创办了中科院工程热物理研究所和中国工程热物理学会。他所创立的“叶轮机械三元流动理论”，为推动国际航空发动机和其它叶轮机械科技发展发挥了重要作用。

吴仲华奖励基金理事会理事长、工程热物理所所长秦伟说：“我们希望通过这项奖励基金的设立使更多的人了解吴先生的高尚情操，用他的精神感动新一代青年学者，激励国内工程热物理领域青年科研人员持续开拓创新，弘扬和光大他毕生致力于科学研究的献身精神。”