乌兰察布市疾病预防控制中心前身为乌兰察布盟卫生防疫站，始建于是1954年，2002年改为乌兰察布盟疾病预防控制中心。2004年8月随撤盟设市改为乌兰察布市疾病预防控制中心。主要职责：全市疾病预防控制、卫生监测检验、科研、人才培训和健康教育技术指导中心。是全市卫生事业单位。

乌兰察布市疾病预防控制中心是全市卫生事业科级单位，隶属于乌兰察布市卫生局。疾控中心现有建筑面积3600平方米，占地面积4000平方米。现有职工162名，其中，高级职称5名，副高级职称12名，中级职称52名，初级职称55名。内部科室设置：人事科、办公室、财务科、总务科、党办；业务科室：流行病科、计划免疫科、艾滋病科、非传染性慢性病科、公共卫生监测一科、二科、三科、四科；职业病科、检验中心、质控管理科、样品受理科、生物制品管理科及职业病门诊等19个科室。