卫生部医学免疫重点实验室于1995年10月由卫生部批准建立。主要由三个相对独立的研究室组成，包括T细胞研究室、免疫调节和自身免疫室、分子免疫室。目前有教授6人，其中学术带头人4人，副教授8人，截止2005年6月，共培养博士研究生92人，其中2人获全国优秀论文奖，2人获全国优秀论文提名奖，硕士研究生人56，博士后14人。

实验室有陈慰峰院士，长江学者高晓明教授，马大龙教授，张毓教授等免疫学专家参与实验室研究，。卫生部医学免疫重点实验室在T细胞发育研究、肿瘤疫苗研究、免疫调节和自身免疫研究、免疫相关功能基因组研究领域取得了一系列的成果，部分成果在国际上产生了影响。2000至2005年以来，承担了各种国家和省部科研任务数十项，包括国家重大专项、“863”计划、“973”计划、自然科学基金重点项目、国家杰出青年基金、北京市重大项目等，科研基金超过2700万。共发表SCI论文72篇，申请专利25件，获得省部级奖励2项。与企业合作的2项基因工程药物获得新药证书，1项基因工程药物进入III期临床实验，1项肿瘤疫苗正在上报SFDA，申请进入临床。

实验室面积约1200平方米，具备配套的免疫学研究、基因研究、细胞研究、蛋白质研究的实验室，重点装备有免疫学、细胞生物学和分子生物学研究的基本仪器设备，价值超过2000万元，包括流式细胞仪，全自动DNA序列分析仪、毛细管电泳仪、定量PCR仪，高压液相色谱仪，酶联斑点图像分析系统，倒置荧光显微镜，显微图像分析系统，低压层析系统，紫外分光光度计，发酵罐，各种离心机等等。具有雄厚的技术基础开展基因克隆化，基因分析，基因表达，蛋白质纯化、鉴定，细胞生物活性测定，免疫功能测定，测定等系列生物医学技术。