潍坊市人民检察院下辖潍城、寒亭、坊子、奎文、临朐、昌乐、高密、青州、诸城、寿光、安丘、昌邑12个县（市、区）检察院和高新院、城郊院2个派出检察院，市院机关下设办公室、政治部、侦查监督处、公诉处、反贪污贿赂局、反渎职侵权局、监所检察处、民事行政检察处、控告申诉检察处、职务犯罪预防处、检察技术处、法律政策研究室、法警支队、行政装备处、监察处、检察委员会办公室等16个内设机构。目前市院共有编制209个，实有167人。

近几年来，该院坚持以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，全面落实科学发展观，紧紧围绕“强化法律监督，维护公平正义”的检察工作主题，坚持以业务工作为中心不动摇，大力加强和改进法律监督工作，不断加强检察队伍建设，各项检察工作创新发展、整体推进，为构建社会主义和谐社会、促进全市经济社会又好又快发展做出了积极贡献，创造了辉煌的业绩。自1985年以来，潍坊市检察院被高检院记集体一等功4次，评为“先进集体”3次、通令嘉奖1次，被省院记集体一等功10次、二等功3次，评为先进集体3次；先后被潍坊市委、市政府授予“先进基层党组织”、“思想政治工作先进单位”、“和谐创建示范单位”等称号。自1993年以来，连续保持“省级文明单位”称号。