微生物中药的概念由山东泰安正信科技有限公司董事长陈莹先生在2001年中医发明家协会年会发表的论文《中医药与微生态医药》中首次提出。

传统中药分为三大类：动物中药、植物中药和矿物中药。灵芝、虫草、天麻等中药被列入了植物中药，因为我们的祖先所处的年代并不知道他们属于微生物。随着生物技术的发展，显微镜的出现，微生物药物大量出现，如乳酸菌片、酵母片、整肠生、促菌生、丽珠肠乐等。这些微生物应该和灵芝虫草一样作为中药应用，应该列入微生物中药的范畴。因此，微生物中药应包括以下内容：真菌类（菌丝体和子实体），细菌类（主要是益生菌类和口服菌苗类）。

微生物中药概念的提出，为中药分类学提供了一个新的起点，为丰富传统中药的品种和应用范围提供了可能，传统中药需要继承更需要发展，本草纲目需要续写，这才是作为炎黄子孙对待中药这一历史瑰宝应有的态度。