天主教京都教区（日语：カトリック京都教区；拉丁语：Dioecesis Kyotensis）位于日本京都市，是罗马天主教在日本设立的16个教区之一，属大阪教省的子教区。辖京都府、奈良、三重、滋贺三县。
该教区的前身为一宗座监牧区，于1937年6月17日从大阪教区分拆出来，至1951年7月12日升格为现在的教区。
宗座监牧（罗马礼）
Patrick Joseph Byrne主教（1937年3月19日－1940年10月10日）
古屋义之主教（Paul Yoshiyuki Furuya，1940年－1951年7月12日）
主教（罗马礼）
古屋义之主教（1951年7月12日－1976年7月8日）
田中健一主教（Paul Yoshiyuki Furuya，1976年7月8日－1997年3月3日）
大冢喜直主教（Paul Yoshinao Otsuka，1997年3月3日－）