孙兆元（生卒年月不详），字鼎文，清代福建浦城人。

清康熙十一年(1672)拔贡生，选授安徽铜陵知县。县民积欠赋税五千多金，前任官捆绑、拘囚、敲击庶民。孙兆元到任，释放全部拘囚，出私钱分年代输，当地人在县署前建恤民亭纪念他。生员徐某，品行恶劣，诬告与他结怨的人以死罪，因怕孙兆元严明，就深夜送三百金贿赂孙兆元，遭孙兆元怒斥。经过审理，结果判徐某诬告罪，褫夺其蓝衫。当涂县有一强盗抢劫被捕后，反诬采石矶居民数10人，县令不能判断，中丞召兆元和芜湖令一起到太平府会审，居民实属冤枉，给以剖雪。居民感德，在采石矶为他盖生祠。孙兆元还捐俸修葺五松山太白书院，每月教生员经艺诗赋。孙兆元在任10年，当地连遭水旱灾害，他施米施粥。将要升迁，因眼聩请求回乡，当地又盖清廉亭来纪念他。为官10年，归家时，囊袋萧然。