斯坦福大学北京大学分校是北京大学和斯坦福大学的重点合作项目，是两校长期友好合作和深厚友谊的结晶。该项目酝酿多年，经过双方的共同努力，终于在2004年9月，在北京大学正式开学。该分校是斯坦福大学海外的第八个分校。

作为斯坦福大学在中国唯一的分校项目，斯坦福大学北京大学分校项目(Stanford Program in Beijing)是北京大学与斯坦福大学深厚友谊和长期友好合作的结晶。该项目采取斯坦福的Quarter制，春秋各开一期，每期项目历时10周。该项目课程有两类，一类是由北大与斯坦福教授用英文开设的有关当代中国的课程，涉及法律、环境、经济、考古、国际关系、艺术、人口学、哲学、文学、科技史、生命科学、工程设计、新闻学等学科领域；一类是由北京大学对外汉语教育学院为其专设的汉语课。除课程教学之外，项目还安排了丰富多彩的教学实践活动和长短途旅行，如到企业和农村调研，参观法院、监狱，访问敬老院，到农民工子弟学校支教，学习中国厨艺等；参观游览北京市内以及国内其他各地的名胜古迹等。自2004年秋季启动以来，迄今已成功举办11期。两校教授开设了50多门课程，有500多位两校学生通过同堂学习及语伴交流等形式参与其中。

首批参加该项目的16名斯坦福大学学生，来自经济、国际关系、管理学、人类学、心理学、东亚研究等专业。在十一周的时间内，他们将学习汉语课程和由北京大学与斯坦福大学教授共同开设的专业课程，内容涉及哲学、法律、环境、考古等方面，授课语言为英文

在此项目基础上，两校友谊不断加深，合作不断深化：2008年4月，两校签署了《北京大学斯坦福中心谅解备忘录》；2009年3月，两校合作开办了跨文化设计项目（Cross-Cultural Design Workshop）；2009年暑期，北大选派了6位北大学生参与斯坦福大学UGVR（the Undergraduate Visiting Research Program）项目，赴斯坦福大学一对一跟从斯坦福大学知名教授进行为期10周的学术研习。