食品安全监察司的工作职责是：依法组织开展对重大、特大事故的查处，负责国家食品安全监察专员日常管理工作，承办局交办的其他事项。国家食品安全监察专员受国家食品药品监督管理局的委托，监督检查有关部门、单位对重点环节和重点领域食品、保健品、化妆品重大安全危害因素的监控与整改情况，参加对重大、特大事故调查处理和应急救援工作。