在生长素与其受体结合之后，会活化一些转录因子，进入细胞核，促进基因表达。这些转录因子分为两类：

1.早期基因或初级反应基因。由原来已有的转录基因活化刺激所致。

2.晚期基因或刺激反应基因。对激素是长期反应，有某些早期基因调节。

生长素响应因子（ARF）会调节早期基因的表达。在没有生长素时，ARF与AUX/IAA蛋白质结合形成不活化的异源二聚体，阻止早期基因的转录，所以无生长素响应。当有生长素时，泛素连接酶被活化，将AUX/IAA破坏，使得两个ARF形成同源二聚体，它与早期基因启动子的回文生长素响应元件结合，转录便活化。早期基因转录引起一系列反应，从而表现出生理反应。