上海市气功研究所是上海中医药大学附属的事业单位，是国内目前规模最大的气功专业研究机构。上海市气功研究所成立于1985年，其前身是上海市中医研究所。从成立至今的二十多年里，本所坚持科学态度、宏扬科学精神，对祖国传统文化瑰宝之一的气功开展了一系列科学研究，取得了一定的成绩，积累了一定的工作基础和经验。

目前该所的行政机构设置有：所长室、办公室、业务科、财务科；业务机构设置有：医学气功综合实验室（国家二级实验室）、气功原理研究室、气功教研室、气功文献情报研究室、气功医疗门诊部。目前全所在职职工58人，其中高级职称13人。该所目前承担国家自然科学基金、国家体育总局、上海市科委、上海市卫生局等国家各级各类科研课题及有关横向协作课题十余项。本所在气功的电生理研究方面，始终保持了国内乃至国际的先进水平。该所重视对外交流和国际合作，从1986年起，定期召开国际气功研讨会，迄今已召开九届；已举办各类国际气功学习班200余期，近千名国际友人通过学习掌握了中国的气功。