上海南方模式生物研究中心是国家科技部863计划生物技术领域“疾病动物模型研发基地”和“上海模式生物研发基地”之一。自2001年成立以来，在上海市科委组织领导下，中心联合沪上多家从事相关研究的高校、科研院所及生物医药研发企业，在国内率先建成规模化遗传工程小鼠（疾病动物）模型研发技术平台，其研发效率和规模达到国内一流、国际先进的水平。

中心主要任务是围绕国家目标，开展模式生物技术及疾病动物模型的研究开发,承担国家和地方科技项目，为上海乃至全国生命科学基础研究和生物医药产业发展提供优质高效的遗传工程小鼠模型研发技术服务和动物实验环境条件及相关模型资源的保障和支撑。

中心坚持以专业技术人才为核心，以模式生物关键技术为龙头的发展思路，聚集了一批学术造诣深、技术精湛的科研技术人才，建立了从基因克隆、转基因或基因剔除质粒构建到小鼠胚胎干细胞操作、显微注射、遗传育种、基因型鉴定、品系繁育、表型分析检测、胚胎冻存等一系列遗传工程小鼠模型研发技术，实现了从目标基因到转基因或基因剔除小鼠模型的流水线研发模式，使模型研发能力达到每年产出100-150种各类转基因或基因剔除小鼠模型的规模。

中心拥有国际水准的SPF级小鼠动物房，小鼠笼位数近两万个。配备设施先进、装备一流的小鼠胚胎干细胞培养室、显微注射室和分子生物学、细胞生物学、蛋白质生化实验室。建成了能够进行小鼠发育生物学、行为学、病理学、血液病学、血液生化、影像学（小动物Micro CT、活体化学发光和荧光成像系统及各类荧光显微镜）、免疫学及内分泌代谢等指标检测分析的小鼠表型分析技术平台（“小鼠医院”）。