上海第二医科大学公共卫生学院在原卫生管理系和预防医学教研室的基础上组建而成，于2002年5月22日成立，卫生部卫生经济研究所所长蔡仁华教授担任学院名誉院长。

上海第二医科大学公共卫生学院现有三个学科群，分别是预防医学、卫生管理和医学相关学科群，下设预防医学、医学营养、卫生政策与管理、卫生信息与管理基础、医学心理学以及全科医学六个学科组。

学院现有社会医学与卫生事业管理、环境卫生和营养卫生三个硕士点，有专职教师40名，其中高级职称17人，博士学位6人，硕士学位15人，在读硕士3人。