山东省渔业资源与生态环境重点实验室主要从事海洋渔业资源与生态系统管理、海水养殖生态与健康养殖模式、海洋渔业生态环境保护与修复3个领域的研究。

自20世纪50年代以来，承担了我国不同历史时期近海渔业资源和渔业环境勘查与研究，以及海水养殖生态的基础研究。掌握了我国近海渔业资源数量分布及其变动，为实施海洋生物资源保护、渔业管理做出了重要贡献；近年来开展了一系列海洋生态系统动力学的研究，初步建立了具有显著陆架特色的我国近海生态系统动力学理论体系，在世界海洋生态系统动力学研究中占居了重要的地位。率先在国内进行了海湾养殖容量的研究，提出了海湾系统多参数养殖容量评估指标和模型，所建立的浅海多元生态优化养殖理论、模式与技术，达到了环境友好、高效健康的目的，居国际先进水平。

实验室有核心成员24人，其中中国工程院院士1人，“泰山学者”特聘专家1人，享受国务院特贴4人，省部级有突出贡献中青年专家3人，水科院水产学科首席科学家2人。 依托单位拥有“北斗”专业调查船1艘；单价5万元以上的大型仪器设备50余台套。