三明市人民政府口岸办公室挂牌于1999年1月，并开始行使职能。2002年9月，省编办正式批准成立三明市人民政府口岸办公室，加挂在三明市对外贸易经济合作局内，与三明市外经贸局合署办公。其人员等均由市外经贸局派员兼任，行使市政府口岸办公室职责。主任李广建兼任，办公室日常工作由市外经贸局外联科兼。三明市人民政府口岸办公室主要职责如下：

1、贯彻执行国家有关口岸工作的方针、政策、法律、法规和规定，并根据口岸地区的具体情况制定实施细则。

2、协调口岸各部门及口岸相关部门贯彻落实市委、市政府有关口岸工作的决策。

3、贯彻和检查国家和地方关于口岸运输指导性计划的执行情况，对口岸运输情况进行统计分析和预测、预报。

4、督促检查口岸各联检联运及有关部门按各自的职能和规定进行工作。

5、协调处理口岸各部门及有关部门（包括检查检验、外贸运输、货代报关、装卸理货、仓储转运、金融税务等）之间的工作关系和矛盾，加速口岸人流、物流的进出，保证口岸畅通。

6、组织口岸各部门对干部职工进行口岸法律、法规、条例、涉外政策、纪律、国家安全和口岸安全畅通的宣传教育。对口岸各联检联运部门执法执纪情况进行监察，并会同有关部门对口岸重大涉外问题和严重违纪情况进行调查和提出处理意见。

7、组织协调口岸各部门及口岸相关部门开展共建社会主义精神文明口岸活动。

8、按上级要求组织、协调实施口岸开放、口岸基础设施建设规划和设计，协调口岸各部门完善口岸区域各自的设施和设备功能。

9、按照国家有关口岸开放的各项政策和规定，负责口岸的开放或关闭的申报工作，并组织落实有关事宜。

10、开展口岸信息调研工作，对口岸工作出现的重大矛盾和问题向上级部门反映，并提出解决意见。

11、承办上级领导部门交办的其它事项。