1942年11月，14岁的阮万钧离开芜湖参加了江北新四军。边学习，边从事皖中行政公署宣教团工作，在艰苦的革命生活中，阮万钧感到了无上的光荣和自豪。1943年12月，阮万钧光荣加入中国共产党。

抗日战争胜利后，蒋介石发动全面内战，向解放区进攻。阮万钧又参加了开封、豫东、济南、淮海、渡江战役等多次重大战斗。1950年6月25日，朝鲜战争爆发。为积极响应“抗美援朝、保家卫国”的号召，1951年3月，时任炮兵63师司令部机要科长的阮万钧又开始了赴朝作战的光荣任务。其间，一次打出军威的战斗让阮万钧终身难忘。1951年4月8日6时20分，美帝空军第一批近百架敌机向63师各团高炮阵地进行猛烈攻击，整整12个小时，在与敌机展开针锋相对的陆空搏斗中，于上午8时将第一架美国F80型战斗机打下来了，并抓获了美军飞行员。战场附近的朝鲜老百姓个个兴高采烈，一位朝鲜老大爷还伸出大拇指高兴地说：“吉原棍曹斯米达（志愿军顶好）！”“这一仗打得好，不仅打痛了美帝国主义的空中强盗，而且也打出了我师的军威。”1952年，阮万钧荣获朝鲜民主主义人民共和国三级国旗勋章。1955年、1987年，阮万钧先后荣获中华人民共和国三级解放勋章、中华人民共和国独立功勋荣誉章。

1953年，阮万钧被调至公安十七师司令部机要科担任科长职务。1978年，任中共淮北市委常委、淮北市人民武装部部长，中国人民解放军宣城军分区副师职顾问。1982年，阮万钧离休返回家乡芜湖，住进陆军干休所。