全新世灭绝事件是于现今的全新世所发生广泛及持续的灭绝或生物集群灭绝事件，是为第6次的灭绝事件。涉及的灭绝集群包括了植物及动物的科，如哺乳动物、鸟类、两栖类、爬行动物及节肢动物，大部份灭绝都是在雨林内发生。于1500年至2006年，世界自然保护联盟就列出了784个已灭绝物种。不过，有很多实际灭绝的物种都没有纪录，一些科学家估计于20世纪，就已有2-200万个物种实际灭绝。根据物种面积曲线估计，每年就有达14万个物种灭绝。

广义来说，全新世灭绝事件包括了于1万年前人类发展及散布开始后造成的巨型动物群消失。是次灭绝事件并非源自气候的转变及／或人类人口过多。这次灭绝事件发生在更新世-全新世界线，故有时被指为第四纪灭绝事件或冰河时期灭绝事件。不过全新世灭绝事件则延伸至现今的21世纪。

就全新世灭绝事件应否包揽近期的灭绝事件，或是只看为单一次的事件而并未有共识。近期的灭绝时件也包含了植物的灭绝。整体而言，这次事件的特征就是人为成因的出现及发生在非常短的时间之内。

人类影响

人类活动导致动物及植物的灭绝可以追溯至更新世晚期。人为因素导致的灭绝事件，与及一些预计的事件，都被指为“人类世灭绝事件”或“人类世集群灭绝”。虽然现今的灭绝事件都有纪录，但其命名却不同。人类世一词就并没有正式的定义，一些会用来指现今及预计发生的灭绝事件。全新世及人类世的界线也不明确，一些学者会将人类影响气候的时期算计在内，其他的则以工业革命为界。

于更新世晚期巨型草食性动物灭绝的成因有两个假说：气候转变及早期人类对生态的影响。猎杀、为了反刍动物及抵抗肉食性或食腐动物而烧毁一些栖息地，都令草食性动物的生存受到影响。