朱氏在唐代入闽有三支，其中一支是唐宰相朱敬则第六代裔孙朱氵解，于唐末从河南南阳避地侯官，后迁居仙游党田，其第八代裔孙朱王丑迁居莆田黄石石阜，另一支是唐宰相朱敬则第八代裔孙朱玑，于唐末从河南固始迁居莆田黄石琳井。所以朱氵解为石阜世系入闽入仙邑之始祖；朱王丑为石阜世系入莆之始祖；朱玑为琳井世系入莆之始祖。

1994年，莆田朱氏代表商定续修朱氏谱牒议案，成立续修族谱编辑委员会，经五年时间，于1999年10月出版《莆田朱氏通谱》第一卷。朱鸿祚任编委主任，朱玉华任总编辑。

《莆田朱氏通谱》第一卷共分五个部分，第一部分《历代族谱摘记》收进旧谱序言、郡望故址、宗派分支、碑记、祀记、祭文、楹联等内容。第二部分《源流概述》分为“入闽入莆仙朱氏源流考”、”颛顼至敬则”、“敬则至入闽”、石阜、琳井世系及莆田朱姓分布等。第三部分《士宦、名人、事迹》介绍朱氏历代将相、莆田朱氏历史名人、历代进士等。第四部分《文物古迹》介绍莆田朱氏墓碑、宗祠、宫庙、手书、石刻等。第五部分《文史摘》选载朱熹《群仙书社记》、《群仙书社祠堂记》、《归乐堂记》，以及《北辰宫记》、《天马山赋》等。

《莆田朱氏通谱》第二卷于2005年10月出版。内容分为：

第一部分《谱序》；第二部分《凡例》；第三部分《谱论》；第四部分《宗亲活动大事记》；第五部分《家训、家政、格言》，主要为朱子家训、家政及朱柏庐治家格言；第六部分为《莆田朱氏源流史略》；第七部分《各村朱氏世（代）系表为本通谱主要内容，计有荔城区40个村落、城厢区20个村落、涵江区8个村落、秀屿区23个村落、湄洲岛2个村落；第八部分为《恩荣录》；第九部分《古代科第官职表》介绍自唐迄清琳井、石阜及未详世系的中第人物、时间与官职；第十部分为《现代学历职位表》；第十一部分为《名迹录》，介绍重点祠庙、井、桥、塔、寨、宫、庙、祠、社等；第十二部分为《历代迁居表》；第十三部分《文史与艺文》，载有祭祖文、祠庙题联、诗词等；第十四部分《杂记》，载有轶闻趣事及莆田朱氏姓联等。