农村能源研究中心是以应用研究为主，围绕农业生物资源的发掘、合理利用与有效保护，开展知识创新、技术创新研究工作。 研究领域：农业废弃物的合理利用．农业立体污染防治。

学科方向：农业废弃物的合理利用研究是以农业生产产生的畜禽粪便、秸秆、农户生活污水、农业特种行业如豆制品废水等为主要原料进行厌氧消化处理的应用研究为发展方向。以研究农村沼气的工艺、装置、管理、后续服务、产业化等解决农户生活用能和技术服务为主；同时进行厌氧消化处理工艺、装置、沼气贮存、输配系统等设备的筛选及结构优化配套研究；在此基础上加强沼气综合利用的机理、方式的深入研究。

农业立体污染防治的研究是在农业废弃物的合理利用时注重生物多样性与生境的关系、重要物种的繁殖行为学和保护生物学研究。通过农户生态家园建设各种模式的实施与组合，使农村庭院生态建设的环境微生物与环境工程研究以环境污染的生物治理为主。重点开展庭院系统内各种生物的生化特性及优势的组合研究，以及微生物治理污染的新工艺、新技术、新设备等研究。从而达到农业生产无害化、庭院生态高效化、家居生活清洁化．

1978 年以来承担了国家攻关课题、国家“863”课题、国家自然科学基金、中国农科院重大、重要方向、院长基金等项目和院地合作项目以及国际合作项目等多项课题。