内双沟溪位于台湾省北部，属于淡水河水系，为内双溪的支流，流域分布于台北市士林区最东端。主流发源于人双溪山 (标高655米) 北麓之风柜嘴 (标高601米)，向西南流至圣人瀑布附近注入内双溪。

内双沟溪流域位于阳明山“国家”公园范围内，设有天溪园生态教育中心。