内蒙古农业大学水利与土木建筑工程学院，其前身为内蒙古畜牧兽医学院的农田水利工程系，始建于1958年。学院下设水利工程系、资源环境系、土木工程系、测绘工程系和水利土木工程综合实验中心，中心下设4个综合实验室，共17个功能实验室。现有教职工98人，其中教授27人，副教授30人，国家级教学名师1人，新世纪“百千万人才工程”国家级人选1人，享受政府特殊津贴和自治区有突出贡献的中青年专家12人。在校本科生2127人，硕士生93人，博士生30人。设有农业水利工程、水文与水资源工程、给水排水工程、环境工程、土木工程、测绘工程6个本科专业，农业水利工程专业为国家特色专业建设点，农业水利工程、水文与水资源工程、土木工程和给水排水工程专业为自治区级品牌专业，拥有6门自治区级精品课程。学院拥有农业工程博士后科研流动站，农业工程一级学科博士授权点，农业水土工程、农业生物环境与能源工程和农业水工建筑物3个二级学科博士点；农业水土工程、水文学及水资源、水工结构工程、农业生物环境与能源工程、水利水电工程、市政工程和结构工程7个硕士点。农业水土工程为国家重点（培育）学科，农业水土工程和水文学及水资源学科为自治区重点学科，水工结构工程为自治区重点（培育）学科；测绘信息实验中心为自治区级实验教学示范中心，水资源保护与利用实验室为自治区重点实验室。

多年来学院一直注重教学、科研、生产相结合，学院教师主持完成多项大型水利工程的勘测设计与施工，水资源水环境调查、评价与水资源论证，水权转换，节水型社会建设与流域规划，灌区规划与设计等生产任务；1993年以来共承担了30项国家自然科学基金项目，其中1项为重点项目。获国家级教学成果二等奖2项，获国家级科技进步三等奖1项、省部级科技进步一等奖4项、二等奖6项、三等奖2项。在国内外核心期刊上发表科技论文386篇，编写出版教材49部。