南京信息工程大学数理学院于2006年8月成立，由原数学系和物理系合并而成，设有信息与计算科学、数学与应用数学、统计学、物理学、应用物理学、材料物理学、光信息科学与技术7个本科专业，有应用数学、空间天气学2个硕士点和空间天气学博士点。其中，数学、物理学、光学工程为中国气象局重点学科，信息与计算科学、应用物理学为江苏省特色专业。另有校重点建设学科2个、校品牌专业2个、校特色专业1个。物理实验教学中心为江苏省实验教学示范中心。学院现有在校本科生1041人，硕士研究生70人。

数理学院共有教职工133人。教师队伍中拥有教授23人，副教授25人，具有硕、博士学历的教师占85%以上。享受受国务院特贴专家3人、博导7人、硕导39人，江苏省“333工程”人才1人、“青蓝工程”中青年学术带头人2人、“青蓝工程”优秀青年骨干教师5人。现承担国家自然科学基金项目3项，主持江苏省自然基金项目2项，主持江苏省高校自然基金8？项，主持横向项目6项，参加气象行业专项2项。近三年来在国内外重要学术刊物上发表论文500余篇，其中SCI、EI、ISTP收录170多篇，成功申报国家专利4项。共出版教材22部，建成江苏省精品课程2门、优秀课程1门，校级精品课程8门，获得省部级教学和科研奖励18项。在历年全国大学生数学建模竞赛、力学竞赛中多次获得全国奖项。

数理学院毕业生总就业率为99％，其中高质量就业率为91.8％，毕业生主要在科研机构、教育、IT行业、气象、通信、金融、材料开发、电子等部门从事科研、教学、软件开发、行业管理及生产应用等工作，同时一大批毕业生考入北大、清华、复旦、南大等著名高校或推荐到国外继续深造，考研升学率一直稳定在23％以上。2008年考研出国率达28%。

2008年8月26日至29日，学院成功举办“首届全国信息光学与光子器件学术会议”，与会代表400余人，促进了国内信息光学研究的交流和发展。

学院现与爱尔兰沃特福德理工学院（Waterford Institute of Technology , Ireland）理学院、法国蒙比利埃大学科技学院、美国乔治-梅森大学理学院联合培养本科生和研究生。