南京市秦淮区政协成立于1962年，至今是第十届委员会。

区政协现任主席王付荣，副主席张来发、阎文斌、陈琳、曾宪苓、刘军、周蜀江。内部机构设置办公室、提案法制委员会、学习文史委员会、经济科技委员会、城市建设委员会、教育卫生委员会。办公室下设秘书科、行政科、联络科。十届政协委员161名，常务委员25名。

秦淮区政协在中共秦淮区委的正确领导下，坚持以邓小平理论、江泽民同志“三个代表”重要思想和胡锦涛同志提出的科学发展观为指导，认真贯彻党的路线、方针、政策，广泛团结全体政协委员和全区各界人士，紧紧围绕区委、区政府的中心工作，切实履行政治协商、民主监督、参政议政的职能，在讲究协商质量，扩大民主监督，提高参政议政实际效果上求发展、求突破，做了大量的工作，为全区两个文明建设作出了积极贡献。九届政协期间，共召开全委会议5次，召开常委会22次，主席会议57次、主席约谈会15次，专委会开展活动218次，委员提出提案647件；形成建议案和调研报告78篇，报送社情民意99件，在各种报刊发表文章68篇。开展了民主评议、委员论坛、政府政协联席会议、委员接待日，积极反映社情民意，拓宽了政协履行职能的新渠道。在工作中，区政协坚持正确的政治方向，在继承中不断发展，在实践中不断创新，在前进中不断开拓，积累了比较丰富的经验，主要是：坚持党委领导、政府支持；坚持围绕中心、服务大局；坚持与时俱进、开拓创新；坚持突出重点、注重实效。

十届区政协成立以来，认真学习贯彻中共十七大精神，全面贯彻《中共中央关于加强人民政协工作的意见》精神，认真研究新的历史条件下政协工作的新特点，积极探索和拓宽政协工作的新领域，牢固确立为中心工作服务的指导思想，深入实际，调查研究，进一步加强政协工作规范化、程序化、制度化，切实履行政协三大职能，充分发挥政协自身优势，努力为实现富民强区、又好又快发展，全面建设小康社会的目标作出新的贡献。